Jest to polecenie ltrsift, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
ltrsift - graficzny interfejs do postprocessingu i klasyfikacji LTR
kandydaci na retrotranspozon
STRESZCZENIE
przesiew
OPIS
LTRsift to graficzne narzędzie komputerowe do półautomatycznego przetwarzania końcowego przewidywanych de novo
Adnotacje retrotranspozonowe LTR, takie jak te generowane przez LTRharvest i LTRdigest.
KONFIGURACJA
Pliki binarne LAST (lastal i lastdb) powinny znajdować się w systemowej ścieżce wyszukiwania. Jeśli oni
nie są, czy można określić ich lokalizację za pomocą środowiska „GT_LAST_PATH”?
zmienna przed uruchomieniem LTRsift. To samo dotyczy lokalizacji BLAST. Posługiwać się
``GT_BLAST_PATH”, aby określić pełną ścieżkę do pliku wykonywalnego „blastall”.
Pliki stylów (opisujące, jak wygląda liniowy diagram cech kandydujących) mogą być
ustawiana za pomocą zmiennej środowiskowej LTRSIFT_STYLE_FILE. Zbudowany jest rozsądny styl domyślny
w LTRsift.
Korzystaj z ltrsift online za pomocą usług onworks.net