To jest polecenie maskAlignedReads, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
maskAlignedReads.py — Maskuj wyrównane odczyty w pliku regionów
OPIS
użycie: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l PLIK LOGOWANIA] [-d] [-i]
inCmpPlik inRgnFofn outRgnFofn
Użyj in.cmp.h5, aby zamaskować odpowiednie regiony plików w in.rgn.h5, zapisz dane wyjściowe w nowym
rgn.ffn.
pozycyjny argumenty:
w pliku Cmp
Plik wejściowy cmp.h5.
wRgnFofn
Lista plików tabeli obszarów wejściowych.
outRgnFofn
Lista plików tabeli obszarów wyjściowych.
fakultatywny argumenty:
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
-v, --wersja
pokaż numer wersji programu i wyjdź
-l PLIK DZIENNIKA, --plik dziennika PLIK DZIENNIKA
Określ plik, do którego chcesz się zalogować. Domyślnie jest to stderr. (domyślnie: Brak)
-d, --odpluskwić
Zwiększa szczegółowość rejestrowania (domyślnie: Fałsz)
-i, --informacje
Wyświetlaj wpisy informacyjne dziennika (domyślnie: Fałsz)
Użyj maskAlignedReads online za pomocą usług onworks.net