To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie qure, której najnowszą wersję można pobrać jako QuRe_v0.99971.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie qure z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZDJĘCIA EKRANU:
Qure
OPIS:
QuRe to program do rekonstrukcji quasi-gatunków wirusowych, opracowany specjalnie do analizy długich odczytów (>100 bp) danych NGS. Oprogramowanie dopasowuje fragmenty sekwencji do genomu referencyjnego, znajduje optymalny podział genomu na przesuwne okna w oparciu o pokrycie i różnorodność oraz próbuje zrekonstruować wszystkie indywidualne sekwencje quasigatunków wirusowych - wraz z ich występowaniem - za pomocą algorytmu heurystycznego, który dopasowuje wielomianowe rozkłady różnych wariantów wirusowych nakładających się na podział genomu. QuRe ma wbudowaną metodę korekcji błędów Poissona i klastrowanie probabilistyczne po rekonstrukcji, oba sparametryzowane na podstawie określonych poziomów błędów w regionach homopolimerowych i niehomopolimerowych.Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/qure/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.