Jest to aplikacja systemu Windows o nazwie Alphafold, której najnowszą wersję można pobrać jako Alphafoldv2.3.2.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie Alphafold z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZDJĘCIA EKRANU:
Alfafold
OPIS:
Ten pakiet zawiera implementację potoku wnioskowania AlphaFold v2.0. To zupełnie nowy model, który został wprowadzony do CASP14 i opublikowany w Nature. Dla uproszczenia, w dalszej części tego dokumentu określamy ten model jako AlphaFold. Każda publikacja, która ujawnia ustalenia wynikające z użycia tego kodu źródłowego lub parametrów modelu, powinna cytować artykuł AlphaFold. Proszę również zapoznać się z informacjami uzupełniającymi w celu uzyskania szczegółowego opisu metody. Możesz użyć nieco uproszczonej wersji AlphaFold z tym notatnikiem Colab lub wersjami wspieranymi przez społeczność. Całkowity rozmiar pobierania dla pełnych baz danych wynosi około 415 GB, a całkowity rozmiar po rozpakowaniu wynosi 2.2 TB. Upewnij się, że masz wystarczająco dużo miejsca na dysku twardym, przepustowość i czas na pobranie. Zalecamy używanie dysku SSD w celu uzyskania lepszej wydajności wyszukiwania genetycznego.
Korzyści
- AlphaFold potrzebuje do uruchomienia wielu genetycznych (sekwencyjnych) baz danych
- Podczas gdy kod AlphaFold jest objęty licencją Apache 2.0, parametry AlphaFold są udostępniane do użytku niekomercyjnego
- 5 modeli, które zostały użyte podczas CASP14 i zostały gruntownie zweryfikowane pod kątem jakości przewidywania struktury
- 5 modeli pTM, które zostały dostrojone do produkcji pTM
- Najprostszym sposobem na uruchomienie AlphaFold jest użycie dostarczonego skryptu Docker
- Domyślnie Alphafold spróbuje użyć wszystkich widocznych urządzeń GPU
Język programowania
Python
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.