This is the Windows app named clusterProfiler whose latest release can be downloaded as clusterProfilersourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
Download and run online this app named clusterProfiler with OnWorks for free.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZDJĘCIA EKRANU:
clusterProfiler
OPIS:
clusterProfiler is an R/Bioconductor package that provides a unified workflow for functional enrichment analysis to interpret high-throughput omics results. It supports both over-representation analysis and gene set enrichment analysis, letting you work with unranked gene lists or ranked statistics from differential pipelines. The package connects to multiple knowledge bases—such as Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH and others—through a consistent interface so you can query different biological lenses without rewriting code. It is designed for breadth, covering coding and non-coding features and thousands of organisms by leveraging continuously updated annotations. Results are returned in tidy, manipulation-friendly structures and pair naturally with rich visualization functions (via companion tooling) to summarize pathways, terms, and gene–set relationships.
Funkcjonalności
- Unified ORA and GSEA workflows across multiple annotation sources
- Broad species support using up-to-date gene annotations
- Tidy outputs that integrate cleanly with downstream R data pipelines
- Built-in visualization of enrichment results through companion plotting tools
- Multi-group comparison utilities (e.g., compareCluster) for cross-condition analysis
- Detailed vignettes and manuals for reproducible, end-to-end enrichment studies
Język programowania
R
Kategorie
This is an application that can also be fetched from https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. It has been hosted in OnWorks in order to be run online in an easiest way from one of our free Operative Systems.