To jest aplikacja dla systemu Windows o nazwie kallisto, której najnowszą wersję można pobrać jako kallisto_windows-v0.50.0.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie kallisto z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZDJĘCIA EKRANU:
kalisto
OPIS:
kallisto to program do niemal optymalnego oznaczania ilościowego transkryptów na podstawie danych RNA-Seq lub, bardziej ogólnie, sekwencji docelowych przy użyciu wysokoprzepustowych odczytów sekwencjonowania. Opiera się na idei wykorzystania pseudoalignmentu do szybkiego określenia odczytów i zgodności celów, bez potrzeby ustawiania.
Według testów porównawczych przeprowadzonych na komputerze stacjonarnym Mac kallisto może określić ilościowo 30 milionów ludzkich odczytów zbiorczych sekwencji RNA w mniej niż 3 minuty, korzystając wyłącznie z odczytanych sekwencji i indeksu transkryptomu, czego zbudowanie może zająć ponad 10 minut. A ponieważ wykorzystuje pseudowyrównanie, jest odporny na błędy w odczytach i zachowuje kluczowe informacje potrzebne do kwantyfikacji. Dzięki temu kalisto jest nie tylko szybkie, ale także bardzo dokładne. W wielu benchmarkach znacznie przewyższa nawet istniejące narzędzia.
Korzyści
- Używa pseudowyrównania
- Szybki i dokładny
- Ilościową masową sekwencję RNA można analizować metodą dociekania
- Można go używać z bustoolami do wstępnego przetwarzania danych dotyczących sekwencji RNA pojedynczych komórek
Język programowania
C
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.