MCPerm: permutacja Monte Carlo SNP do pracy tylko w systemie Windows

To jest aplikacja systemu Windows o nazwie MCPerm: Monte Carlo SNP permutation do uruchamiania w systemie Windows online przez Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako MCPerm_1.1.2.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.

 
 

Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie MCPerm: Monte Carlo SNP permutation, aby działać online w systemie Windows przez Linux online z OnWorks za darmo.

Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:

- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.

- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.

- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.

- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.

- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.

- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.

- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.

Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.

MCPerm: permutacja Monte Carlo SNP do uruchamiania w systemie Windows online przez Linux online



OPIS:

MCPerm: metoda permutacji Monte Carlo dla korelacji wielu testów w badaniu skojarzeń kliniczno-kontrolnych
Tradycyjny test permutacji (TradPerm) jest ważną nieparametryczną metodą analizy, która może być traktowana jako złoty standard dla wielu poprawek testowych w badaniu asocjacyjnym kliniczno-kontrolnym. Jednak opiera się na oryginalnych danych dotyczących genotypów i fenotypów polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (SNP) w celu wykonania dużej liczby losowych przetasowań, a zatem jest intensywny obliczeniowo, zwłaszcza w przypadku badania asocjacyjnego całego genomu (GWAS). Aby poprawić szybkość obliczeń bez zmiany wielkości wartości p TradPerm, opracowaliśmy metodę permutacji Monte Carlo (MCPerm) jako wydajną alternatywę dla TradPerm.
Metody: MCPerm nie musi tasować oryginalnych danych genotypów i fenotypów. Wykorzystuje metodę Monte Carlo, wykorzystuje dwustopniowy rozkład hipergeometryczny w celu wygenerowania losowej liczby genotypów (AA, Aa i aa) w przypadkach i kontrolach.

Język programowania

S / R



Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/mcperm/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.



Najnowsze programy online dla systemów Linux i Windows


Kategorie do pobrania Oprogramowanie i programy dla Windows i Linux