Este é o comando fdnadiste que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas múltiplas estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online de Windows ou emulador online de MAC OS.
PROGRAMA:
NOME
fdnadist - Programa Matriz de Distância de sequência de ácido nucleico
SINOPSE
fdnadista -seqüência seqsetall -método Lista -gama Lista -categorias número inteiro -avaliar ordem
-categorias Propriedades [-pesos Propriedades] -gamacoeficiente flutuar
-invarfrac flutuar -tratio flutuar -freqsfrom alternancia -basefreq ordem
[-mais baixo booleano] [-legível por humanos booleano] -arquivo de saída arquivo de saída [-imprimir dados booleano]
[-progresso booleano]
fdnadista -Socorro
DESCRIÇÃO
fdnadista é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Filogenia: Sequência molecular".
OPÇÕES
Entrada seção
-seqüência seqsetall
Arquivo contendo um ou mais alinhamentos de sequência
-método Lista
Valor padrão: modelo de distância F84
-gama Lista
Valor padrão: Nenhum parâmetro de distribuição usado
-categorias número inteiro
Valor padrão: 1
-avaliar ordem
Valor padrão: 1.0
-categorias Propriedades
Arquivo de categorias de taxas de substituição
-pesos Propriedades
Adicional seção
-gamacoeficiente flutuar
Valor padrão: 1
-invarfrac flutuar
Valor padrão: 0.0
-tratio flutuar
Valor padrão: 2.0
-freqsfrom alternancia
Valor padrão: Y
-basefreq ordem
Valor padrão: 0.25 0.25 0.25 0.25
-mais baixo booleano
Valor padrão: N
-legível por humanos booleano
Valor padrão: @($(método)==s?Y:N)
saída seção
-arquivo de saída arquivo de saída
-imprimir dados booleano
Valor padrão: N
-progresso booleano
Valor padrão: Y
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