Este é o comando masai_output_pe que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
masai_output_pe - Saída Masai - Modo Final Emparelhado
SINOPSE
masai_output_pe [OPÇÕES]
DESCRIÇÃO
Masai é um mapeador de leitura rápida e precisa baseado em sementes aproximadas e múltiplas
retrocedendo.
See http://www.seqan.de/projects/masai para obter mais informações.
(c) Copyright 2011-2012 de Enrico Siragusa.
-h, --Socorro
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--versão
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Opções de emparelhamento:
-ng, - sem lacunas
Não alinhe leituras com lacunas.
-todos, - comprimento da biblioteca NUM
Comprimento da biblioteca. Padrão: 220.
Eles, --library-error NUM
Tolerância do comprimento da biblioteca. Padrão: 50.
Opções de saída:
-t, --tmp-pasta STR
Especifique uma pasta temporária grande. Padrão: use a pasta genoma.
-o, --arquivo de saída ARQUIVO
Especifique um arquivo de saída. Padrão: use o prefixo lê o nome do arquivo. Tipos de arquivos válidos
são: raw e sam.
-nc, - sem charuto
Não produza string CIGAR. Isso afeta apenas a saída do SAM.
Opções de depuração:
-WL, --sem despejo
Não despeje os resultados.
VERSÃO
masai_output_pe version: 0.7.1 [14053] Última atualização 2013-05-16
Use masai_output_pe online usando serviços onworks.net