mincconcat - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

mincconcat - concatena arquivos minc ao longo de uma dimensão específica

SINOPSE

minconcat [ ] .mnc [ .mnc ...] .mnc

DESCRIÇÃO

Minconcat irá concatenar vários arquivos minc, produzindo uma única saída
Arquivo. A concatenação é feita ao longo de uma dimensão especificada, com as fatias sendo classificadas
em ordem crescente. A dimensão de concatenação pode ser uma dimensão no arquivo,
nesse caso, as coordenadas para classificação são obtidas diretamente dos arquivos de entrada, ou pode
ser uma nova dimensão e as coordenadas são especificadas com uma opção de linha de comando.

OPÇÕES

Observe que as opções podem ser especificadas de forma abreviada (desde que sejam exclusivas) e
pode ser fornecido em qualquer lugar na linha de comando.

Geral opções

-2 Crie um arquivo de saída no formato MINC 2.0.

-espancar
Substitua um arquivo existente.

-noclobber
Não substitua um arquivo existente (padrão).

-verboso
Imprima informações de progresso para cada bloco de dados copiado (padrão).

-quieto Não imprima informações de progresso.

-max_chunk_size_in_kb tamanho
Especifique o tamanho máximo do buffer de cópia (em kbytes). O padrão é 4096 kbytes.

-lista de arquivos nome do arquivo
Especifique um arquivo contendo uma lista de nomes de arquivos de entrada. Se "-" for fornecido, então o arquivo
nomes são lidos de stdin. Se esta opção for fornecida, então não deve haver entrada
nomes de arquivos especificados na linha de comando. Linhas vazias no arquivo de entrada são
ignorado.

saída tipo opções

-tipo de arquivo
Não faça nenhuma conversão de tipo (padrão).

-byte Escreva voxels inteiros de 8 bits.

-baixo Escreva voxels inteiros de 16 bits.

-int Escreva voxels inteiros de 32 bits.

-longo Substituído por -int.

-flutuador Escreva valores de ponto flutuante de precisão simples.

-Duplo
Escreva valores de ponto flutuante de precisão dupla.

-assinado
Escreva os valores como inteiros com sinal (padrão para curto e longo). Ignorado por
tipos de ponto flutuante.

- sem assinatura
Escreva os valores como inteiros sem sinal (padrão para byte). Ignorado por flutuar
tipos de pontos.

-intervalo_válido minutos max
Especifica o intervalo válido de valores de voxel de saída em sua representação inteira.
O padrão é o intervalo completo para o tipo e sinal. Esta opção é ignorada por
valores de ponto flutuante.

Concatenação opções

-concat_dimension nome
Especifica o nome da dimensão de concatenação. Se a dimensão existe na entrada
arquivos, então as coordenadas são obtidas a partir desses arquivos. Se não, então uma nova dimensão é
criado e a coordenada para cada arquivo de entrada é obtida das opções de linha de comando.
O padrão é usar a dimensão de variação mais lenta do primeiro arquivo.

-Começar começo
Especifica a coordenada inicial para a nova dimensão (padrão = 0.0).

-degrau passo
Especifica a separação entre voxels para a nova dimensão (padrão = 1.0).

-largura largura
Especifica a largura (constante) de cada amostra ao longo da nova dimensão (padrão =
Nenhum).

-lista de coordenadas c1, c2, ...
Especifica uma lista separada por vírgulas de coordenadas ao longo da nova dimensão.

-lista de largura w1, w2, ...
Especifica uma lista separada por vírgulas de larguras ao longo da nova dimensão.

-filestarts s1, s2, ...
Especifica uma lista separada por vírgulas de deslocamentos para as origens das coordenadas para cada um
os arquivos listados na linha de comando. Esta opção é útil para concatenar arquivos
ao longo de uma dimensão existente, por exemplo, para concatenar várias execuções funcionais
ao longo de um tempo dimensão.

-check_dimensions
Verifique se todos os arquivos de entrada têm amostras correspondentes nas dimensões do mundo (padrão).

-nocheck_dimensions
Ignore quaisquer diferenças entre os arquivos de entrada na amostragem de dimensões mundiais.

-cendente
Classifica as coordenadas em ordem crescente (padrão).

-descendente
Classifique as coordenadas em ordem decrescente.

-intercalado
Classifique as lajes por suas coordenadas de dimensão, intercalando se necessário (padrão).

-sequencial
Não classifique as lajes, apenas concatene-as. AVISO - isso vai destruir o
informações de dimensão ao longo da dimensão de concatenação, substituindo o início e
passo com zero e um.

Generic opções para todos os comandos:

-Socorro Imprime o resumo das opções da linha de comando e sai.

-versão
Imprima o número da versão do programa e saia.

EXEMPLOS

Para concatenar dois volumes com dimensões zspace, yspace, xspace, tendo intercalado
fatias ao longo do zspace, podemos simplesmente usar

mincconcat entrada1.mnc entrada2.mnc saída.mnc

Se tivermos um monte de imagens compactadas (yspace, xspace) que desejamos concatenar em
um volume uniformemente espaçado, então podemos digitar

mincconcat entrada1.mnc.gz entrada2.mnc.gz entrada3.mnc.gz
entrada4.mnc.gz saída.mnc
-concat_dimension zspace -start -23 -etapa 2

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