Este é o aplicativo do Windows chamado kallisto cuja versão mais recente pode ser baixada como kallisto_windows-v0.50.0.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado kallisto com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
CAPTURAS DE TELA:
Kalisto
DESCRIÇÃO:
kallisto é um programa para quantificação quase ideal de abundâncias de transcritos de dados de RNA-Seq, ou mais geralmente de sequências alvo usando leituras de sequenciamento de alto rendimento. Baseia-se na ideia de usar pseudoalinhamento para determinar rapidamente a compatibilidade de leituras e alvos, sem necessidade de alinhamento.
De acordo com benchmarks feitos em um computador desktop Mac, o kallisto pode quantificar 30 milhões de leituras de RNA-seq humano em menos de 3 minutos com apenas as sequências de leitura e um índice de transcriptoma, que por si só pode levar mais de 10 minutos para ser construído. E como usa pseudoalinhamento, é robusto a erros nas leituras e preserva as principais informações necessárias para a quantificação. Isso torna o kallisto não apenas rápido, mas também altamente preciso. Em muitos benchmarks, ele supera em muito as ferramentas existentes.
Funcionalidades
- Usa pseudoalinhamento
- Rápido e preciso
- RNA-Seq em massa quantificado pode ser analisado com detetive
- Pode ser usado com bustools para pré-processar dados RNA-seq de célula única
Linguagem de Programação
C
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.