cmtk-reformatx - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

reformatx - Reformator de volum

REZUMAT

reformatx [opțiuni] --floating floatingImg target x0 [x1 ...]
SAU reformatx [opțiuni] țintă [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
SAU UNDE x0 ... xN și xx0 ... xxN este [{-i,--inverse}] transformare##. (Dacă primul
transformarea în secvență este inversată, apoi „--inverse” trebuie precedat de „--”,
adică, utilizați „-- --inverse xform.path').

DESCRIERE

Instrument de reformat volum extins pentru a calcula imagini reformatate și hărți jacobiene din
secvențe arbitrare de transformări concatenate

OPŢIUNI

Caritate Setul de instrumente Opţiuni (aceste sunt comun by toate CMTK instrumente)
--Ajutor
Scrieți lista cu opțiunile de bază ale liniei de comandă la ieșirea standard.

--ajută-toți
Scrieți lista completă a opțiunilor de linie de comandă de bază și avansate la ieșirea standard.

--wiki
Scrieți lista de opțiuni de linie de comandă la ieșirea standard în marcajul MediaWiki.

--om
Scrieți sursa paginii de manual în marcajul „nroff” la ieșirea standard.

--versiune
Scrieți versiunea setului de instrumente în ieșirea standard.

--ecou
Scrieți linia de comandă curentă la ieșirea standard.

--nivel-verbos
Setați nivelul de verbozitate.

--verbos, -v
Creșteți nivelul de verbozitate cu 1 (învechit; acceptat pentru compatibilitate cu versiunea anterioară).

--fire
Setați numărul maxim de fire paralele (pentru fire POSIX și OpenMP).

--outputtype
Tip de date scalare pentru imaginea de ieșire. Valori acceptate: „char”, „byte”, „short”,
„ushort”, „int”, „uint”, „float”, „double” sau utilizați una dintre următoarele:

--car
8 biți, semnat

--octet
8 biți, nesemnați

--mic de statura
16 biți, semnat

--scurt
16 biți, nesemnați

--int
32 de biți semnat

--uint
32 de biți nesemnați

--pluti
32 de biți virgulă mobilă

--dubla
64 de biți virgulă mobilă

--pad-out , -P
Valoare de completare pentru imaginea de ieșire [Mod implicit: 0]

Opţiuni pentru Simplu Reformatarea
--interpolare
Metoda de interpolare a imaginii. Valori acceptate: „liniar”, „nn”, „cubic”, „pv”, „sinc-
cosinus”, „sinc-hamming”, unde implicit este „liniar”, sau utilizați una dintre următoarele:

--liniar
Interpolare triliniară [Acest is il Mod implicit]

--nn Interpolarea celui mai apropiat vecin

--cub
Interpolare tricubică

--pv Interpolare parțială a volumului

--sinc-cosinus
Interpolare sinc cu fereastra cosinus

--sinc-hamming
Sinc interpolare cu fereastra Hamming

--sinc-raza-ferestrei
Raza ferestrei pentru interpolarea Sinc [Mod implicit: 3]

--conserva-masa
Reformatare care păstrează masa: înmulțiți fiecare valoare reformatată cu cea iacobiană
determinant al transformării aplicate.

Opţiuni pentru iacobian Hartă Reformatarea
--jacobian-corect-global
Hărți iacobiene corecte pentru scară globală.

--no-jacobian-corect-global
Nu corectați hărțile jacobiene la scară globală. [Acest is il Mod implicit]

Intrare Opţiuni
--target-grid
Definiți grila țintă pentru reformare ca Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(dims:pixel:offset)

--masca, -m
Utilizați datele pixelului țintă ca mască binară.

--a decupa
Decupați imaginea țintă: x0,y0,z0,x1,y1,z2

--target-offset , -O
Ignorați decalajul imaginii țintă și setați la x,y,z mm

--target-offset-pixels
Ignorați decalajul imaginii țintă și setați la pixeli dx,dy,dz

--plutitoare , -F
Formatul și calea imaginii plutitoare. [Mod implicit: NICI UNUL]

--pad-plutitoare
Valoare de completare pentru imaginea plutitoare [Mod implicit: dezactivat]

producție Opţiuni
--outfile , -o
Formatul și calea imaginii de ieșire. [Mod implicit: reformat.nii ]

Imagine/Transformare Baza de date
--db
Calea către baza de date de imagini/transformare care ar trebui actualizată cu cea nou creată
imagine. [Mod implicit: NICI UNUL]

AUTORI

Torsten Rohlfing, cu contribuții de la Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff și Yaroslav Halchenko

Utilizați cmtk-reformatx online folosind serviciile onworks.net