fa2dna - Online în cloud

Aceasta este comanda fa2dna care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS

PROGRAM:

NUME


fa2dna - formatați baza de date fasta pentru utilizare cu ANFO

REZUMAT


fa2dna [ opțiune | fişier ... ]

DESCRIERE


fa2dna citește unul sau mai multe fișiere în format fasta și le reformatează într-o bază de date adecvată
pentru anpho(1). Fișierele de intrare pot conține mai mult de o secvență și fiecare secvență poate
fi împărțit în mai multe contigs de o întindere de Ns. Toate codurile de ambiguitate IUPAC sunt
pe deplin sprijinit.

OPŢIUNI


-V, --versiune
Tipăriți numărul versiunii și ieșiți.

-o fișier, --fișier de ieșire
Scrie ieșire în fişier.fişier ar trebui să se termine în .dna, Deoarece anpho iar unele în aval
instrumentele s-ar putea împiedica de o extensie diferită. Implicit este numele genomului cu
il .dna extensie.

-m N, --maxn N
Setează numărul maxim de Ns să fie interpretat ca coduri de ambiguitate IUPAC pentru N; orice
întindere mai lungă este interpretată ca contig separatori. Implicit este 2.

-g nume, --genom nume
Setează numele genomului la nume. Acest nume este stocat în fișierul de ieșire și va fi
folosit de anpho pentru a identifica genomul potrivit în rezultatul său. Genomul ar trebui să fie a
prefixul numelui fișierului de ieșire pentru a permite instrumentelor din aval să îl găsească. Numele
ar trebui să fie scurt, dar unic, ceva de genul „hg18” sau „pt2” pentru om sau cimpanzeu
genomul ar funcționa bine.

-d text, --text de descriere
Adaugă a) Sport and Nutrition Awareness Day in Manasia Around XNUMX people from the rural commune Manasia have participated in a sports and healthy nutrition oriented activity in one of the community’s sports ready yards. This activity was meant to gather, mainly, middle-aged people from a Romanian rural community and teach them about the benefits that sports have on both their mental and physical health and on how sporting activities can be used to bring people from a community closer together. Three trainers were made available for this event, so that the participants would get the best possible experience physically and so that they could have the best access possible to correct information and good sports/nutrition practices. b) Sports Awareness Day in Poiana Țapului A group of young participants have taken part in sporting activities meant to teach them about sporting conduct, fairplay, and safe physical activities. The day culminated with a football match. ca descriere a metadatelor. Acesta este pur informativ.

-v, --verbos
Determină imprimarea unui indicator de progres.

Utilizați fa2dna online folosind serviciile onworks.net



Cele mai recente programe online Linux și Windows