Aceasta este comanda fastaq-to_fasta care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
fastaq_to_fasta - Convertește o varietate de formate de intrare în format FASTA frumos formatat
DESCRIERE
utilizare: fastaq_to_fasta [opțiuni]
Convertește o varietate de formate de intrare în format FASTA frumos formatat
pozitional argumente:
infile Numele fișierului de intrare. Poate fi oricare dintre FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
outfile
Numele fișierului de ieșire
facultativ argumente:
-h, --Ajutor
afișați acest mesaj de ajutor și ieșiți
-l LINE_LENGTH, --line_length LINE_LENGTH
Numărul de baze pe fiecare linie de secvență a fișierului de ieșire. Setați la zero pentru nr
întreruperi de linie în secvențe [60]
-s, --strip_after_whitspace
Eliminați totul după primul spațiu alb din fiecare nume de secvență
-u, --check_unique
Mori dacă oricare dintre numele secvenței de ieșire nu este unic
Utilizați fastaq-to_fasta online folosind serviciile onworks.net