Aceasta este comanda xtratore care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
xtratore - extrage secvențe corespunzătoare caracteristicilor adnotate din secvența dată
fişier
REZUMAT
xtractor [Opțiuni] caracteristici.gff3 secvente.fasta
DESCRIERE
Opțiuni:
-d|--depanare
ieșirea de depanare a imprimării
-h|--ajutor
imprimați acest mesaj de ajutor și ieșiți
-i|--idfile: FIȘIER
fișier care conține o listă de ID-uri de caracteristică (1 pe linie fără spații); dacă este prevăzut,
vor fi extrase numai caracteristicile cu ID-uri din acest fișier
-o|--fișier: FIȘIER
fișier în care vor fi scrise secvențele de ieșire; implicit este terminal (stdout)
-t|--tip: STRING
tipul de caracteristică de extras; poate fi folosit de mai multe ori pentru a extrage caracteristici ale mai multor
Tipuri
-v|--versiunea
imprimați numărul versiunii și ieșiți
-V|--verbos
tipăriți mesaje de avertizare și eroare detaliate
-w|--latime: INT
lățimea fiecărei linii de secvență din ieșirea Fasta; implicit este 80; setat la 0 pentru nr
formatare
Utilizați xtratore online folosind serviciile onworks.net