Aceasta este aplicația Linux numită CaptureProbe a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca Runningexample.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită CaptureProbe cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CaptureProbe
DESCRIERE:
Aici, am dezvoltat CaptureProbe, un instrument Java ușor de utilizat și grafic pentru proiectarea sondelor de captură pentru aplicațiile Capture Hi-C. CaptureProbe este ușor de utilizat, necesită doar fișiere de intrare simple și oferă parametri abundenți pentru proiectarea sondelor. CaptureProbe poate proiecta sonde în mod specific atât pentru site-urile genomice, cât și pentru regiunile genomice de interes. Comparațiile cu software-urile existente (HiCapTools și GOPHER) au indicat că CaptureProbe are un raport bun de succes al designului și o specificitate mai bună a sondei.
Referire: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: un instrument java pentru proiectarea sondelor pentru aplicații de capturare Hi-C. Zool Res [J], 41: 94-96.
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.