Aceasta este aplicația Linux numită isiKnock, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca isiKnockv1.0.0.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită isiKnock pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
isiKnock să ruleze online în Linux
DESCRIERE:
Căile de semnalizare sunt procese complexe și împletite. Perturbarea sistemelor biologice poate dezvălui interacțiunea complicată și dependențele componentelor căii.isiKnock este un software pentru a efectua și vizualiza automat knockout-urile in silico pentru căile de semnalizare (Hannig et al. 2019). isiKnock prezice comportamentul knock-out pe baza calculului fluxurilor de semnal la starea de echilibru. Pentru o explicație a conceptului de knockouts in silico, ne referim la Scheidel și colab. 2016 și Amstein și colab. 2017.
Hannig şi colab. (2019) isiKnock: in silico knockouts in signaling pathways, Bioinformatica, 35(5), 892–894
Amstein şi colab. (2017) Invarianții lamantinului dezvăluie căi funcționale în rețelele de semnalizare. Biologia sistemelor BMC, 11(1), 72.
Scheidel şi colab. (2016) Studii in silico knockout ale captării xenofagice a Salmonella. Biologie computațională PLoS, 12(12), e1005200.
DESCRIERE
- Biologie sistemelor
- Knockout in silico
- Perturbații
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/molbi-isiknock/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.