Aceasta este aplicația Linux numită MAF, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca MAF.zip. Poate fi rulată online în furnizorul de găzduire gratuită OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MAF cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
MAF
DESCRIERE:
Secvențele nucleotidice de ADN și ARN sunt un element omniprezent al tuturor celulelor biologice și servesc, pe de o parte, ca o bibliotecă cuprinzătoare de capabilități pentru celule și, pe de altă parte, ca un sistem de reglare impresionant pentru controlul funcției celulare. Cadrul de aliniere multiplă (MAF) prezentat ar trebui să ofere cercetătorilor o platformă simplă de aliniere a secvențelor ca șablon funcțional, suficient de flexibil pentru a ajusta toți pașii, dar și suficient de cuprinzător pentru a uni multe instrumente diferite și combinații de parametri personalizați dacă este necesară sau recomandată o analiză aprofundată, de exemplu, în situații cu rată de citire scăzută. Platforma permite cercetătorilor să aplice mai mulți aliniatori de secvențe și alte instrumente de pre- și postprocesare în combinații flexibile pentru a analiza diferențele subtile până la remarcabile dintre diferiți algoritmi de aliniere și procesare a secvențelor aplicați aceleiași baze de date.
Citați următoarea publicație: https://doi.org/10.3390/mps8030065
Categorii
- Aplicarea în comun a diferitelor instrumente de aliniere exemplificată prin scripturi bash
- Pași flexibili de pre- și post-procesare, extensibili și complet reproiectabili
- Șabloane Bash care economisesc timp de dezvoltare
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi descărcată și de la https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/. A fost găzduită în OnWorks pentru a putea fi rulată online în cel mai simplu mod de pe unul dintre sistemele noastre de operare gratuite.