Aceasta este aplicația Linux numită metawatt, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca MetaWatt-3.5.3.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită metawatt pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
metawatt pentru a rula în Linux online
DESCRIERE:
Metawatt binner este un instrument grafic de binning care folosește statistici multivariate ale frecvențelor tetranucleotidelor și binning bazat pe acoperire diferențială. De asemenea, efectuează evaluarea taxonomică a calității binning (prin diamant BLASTx). Binele create pot fi editate și exportate ca fasta. Metawatt este implementat în Java SWING și depinde minim de Diamond, HMMer3.1, BBMap, Prodigal și biblioteca Batik pentru exportul de grafică SVG.Citate: Strous M, Kraft B, Bisdorf R, TegetMeyer H (2012) Binning of metagenomic contigs for microbial physiology of mixed cultures. Frontiere în fiziologia și metabolismul microbian 3:410. doi: 10.3389/fmicb.2012.00410
Categorii
- Tetranucleotide combinate și separarea cu acoperire diferențială a contigurilor metagenomice
- Interfață grafică cu utilizatorul pentru explorarea datelor
- Profilarea taxonomică a containerelor cu Diamond blastp
- Detectarea genelor conservate cu o singură copie
- Arborarea filogenetică a containerelor bazată pe gene conservate
- Grafice interactive GC/acoperire sau acoperire/acoperire
- De asemenea, rulează complet automat pe linia de comandă
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Java Swing
Limbaj de programare
Java
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/metawatt/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.