Aceasta este aplicația Linux numită MOIRAI a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca moirai20140528.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MOIRAI cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
MOIRAI
DESCRIERE:
Analiza Cap a expresiei genelor (CAGE) este o tehnologie bazată pe secvențiere pentru a captura capetele 5’ ale ARN-urilor dintr-o probă biologică. După cartografiere, un vârf CAGE pe genom indică poziția unui site de început transcripțional activ (TSS) și numărul de citiri corespunde nivelului său de expresie. CAGE este folosit în mod proeminent atât în proiectul FANTOM, cât și în proiectul ENCODE.
MOIRAI este un sistem de flux de lucru compact, dar flexibil, conceput pentru a efectua pașii principali în procesarea și analiza datelor CAGE. MOIRAI are o interfață grafică care permite cercetătorilor din laboratorul umed să creeze, să modifice și să ruleze fluxuri de lucru de analiză. În fluxurile de lucru sunt încorporați indicatori grafici de control al calității care permit utilizatorilor să evalueze calitatea datelor și să identifice rapid potențialele probleme. Pachetul MOIRAI vine cu trei fluxuri de lucru principale care permit utilizatorilor să mapeze, să adnoteze și să efectueze o analiză a expresiei pe mai multe mostre.
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Perl, C, PHP, Java
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de pe https://sourceforge.net/projects/moirai/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.