Aceasta este aplicația Linux numită MspJI-seq_pipeline1.0, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca pipeline1.0.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MspJI-seq_pipeline1.0 pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
MspJI-seq_pipeline1.0 să ruleze online în Linux
DESCRIERE:
MspJI-seq_pipeline1.0 este o conductă pentru secvențierea digerării MspJI în studiul de metilare a ADN-ului. Digestia MspJI cu endonuclează de restricție dependentă de modificare, cuplată cu secvențierea următoarei generații, ar putea estima starea de metilare a locației citozinei „CNNR” în genom prin cartografierea citirilor cu randament ridicat la secvențele de referință. MspJI-seq_pipeline1.0 este conceput pentru a fi un program de cartografiere cu scop general pentru a gestiona aceste caracteristici speciale ale MspJI-seq. Alinierea sa se bazează pe programul open source SOAP (Short Oligo Alignment Program), iar recunoașterea site-urilor mCNNR este realizată prin expresie regulată în perl.Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Perl
Mediul bazei de date
Fișier plat
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/mspjiseqpipelin/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.