Aceasta este aplicația Linux numită ProGraphMSA a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca ProGraphMSA-20130709.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită ProGraphMSA cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
ProGraphMSA
DESCRIERE:
ProGraphMSA este un instrument de aliniere a secvențelor multiple de ultimă generație care produce modele de decalaje sensibile din punct de vedere filogenetic, menținând în același timp robustețea, permițând îmbinări alternative și erori în modelul de ramificare al arborelui ghid. Acest lucru se realizează prin încorporarea unei reprezentări de secvență bazată pe grafic ca în POA și o combină cu avantajele algoritmului conștient de filogenie din Prank. În plus, luăm în considerare variațiile modelului de substituție prin utilizarea frecvențelor estimate de aminoacizi și prin implementarea profilurilor specifice contextului ca în CS-Blast.Cele mai recente versiuni ale ProGraphMSA includ și extinde modelul de aliniere pentru a suporta inserările și ștergerile de unități repetate în tandem.
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/prographmsa/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.