Aceasta este aplicația Linux numită proSeq, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată sub forma proseq4.2_linux.zip. Poate fi rulată online pe furnizorul de găzduire gratuită OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online gratuit această aplicație numită proSeq cu OnWorks.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
proSeq
DESCRIERE:
ProSeq („Procesor de secvențe”) este un pachet care include programe GUI și linie de comandă pentru procesarea și analizarea datelor despre polimorfismul ADN.
Permite deschiderea și salvarea datelor secvențiale în peste o duzină de formate de fișiere (și conversia între aceste formate). Afișează alinierile secvențelor într-o fereastră grafică și permite utilizatorului să editeze, să manipuleze și să analizeze secvențele în diverse moduri.
ProSeq4 include instrumente pentru analiza polimorfismului ADN, scanarea pentru selecție, efectuarea PCA și reconstrucția filogeniei din date secvențiale sau SNP.
Programul poate, de asemenea, rula simulări coalescente și poate genera și vizualiza filogenii.
Principalele modificări ale Proseq4 în comparație cu Proseq3:
- Multiplatformă. Binare disponibile pentru Windows, Mac și Ubuntu.
- Acum este un program pe 64 de biți, care poate gestiona seturi de date mai mari (la scară genomică de la mai mulți indivizi).
- TreeViewer poate afișa mai multe filogenii în stil densiTree
- Analiza componentelor principale
Declinare de responsabilitate: Nu se oferă nicio garanție - utilizați pe propriul risc
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/proseq/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.