Aceasta este aplicația Windows numită clusterProfiler, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată sub numele clusterProfilersourcecode.tar.gz. Poate fi rulată online în furnizorul de găzduire gratuită OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită clusterProfiler cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
CAPTURĂ DE ECRAN:
clusterProfiler
DESCRIERE:
clusterProfiler este un pachet R/Bioconductor care oferă un flux de lucru unificat pentru analiza de îmbogățire funcțională, în vederea interpretării rezultatelor omice de mare randament. Acesta acceptă atât analiza de suprareprezentare, cât și analiza de îmbogățire a seturilor de gene, permițându-vă să lucrați cu liste de gene neclasificate sau statistici clasificate din conducte diferențiale. Pachetul se conectează la mai multe baze de cunoștințe - cum ar fi Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH și altele - printr-o interfață consistentă, astfel încât să puteți interoga diferite lentile biologice fără a rescrie codul. Este conceput pentru o gamă largă de aplicații, acoperind caracteristici de codificare și necodificare și mii de organisme, utilizând adnotări actualizate continuu. Rezultatele sunt returnate în structuri ordonate, ușor de manipulat, și se asociază în mod natural cu funcții bogate de vizualizare (prin intermediul instrumentelor complementare) pentru a rezuma căile, termenii și relațiile dintre gene și set.
Categorii
- Fluxuri de lucru ORA și GSEA unificate pe mai multe surse de adnotare
- Suport larg pentru specii folosind adnotări genetice actualizate
- Rezultate ordonate care se integrează perfect cu conductele de date R din aval
- Vizualizare încorporată a rezultatelor îmbogățirii prin intermediul instrumentelor de reprezentare grafică însoțitoare
- Utilitare de comparare multi-grup (de exemplu, compareCluster) pentru analiza condițiilor încrucișate
- Vinete și manuale detaliate pentru studii de îmbogățire complete, reproductibile
Limbaj de programare
R
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi descărcată și de la https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. A fost găzduită în OnWorks pentru a putea fi rulată online în cel mai simplu mod de pe unul dintre sistemele noastre de operare gratuite.