Aceasta este aplicația Windows numită kallisto a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca kallisto_windows-v0.50.0.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită kallisto cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
CAPTURĂ DE ECRAN:
kalisto
DESCRIERE:
kallisto este un program pentru cuantificarea aproape optimă a abundențelor de transcriere din datele ARN-Seq sau, mai general, a secvențelor țintă folosind citiri de secvențiere cu randament ridicat. Se bazează pe ideea utilizării pseudoalinierii pentru a determina rapid citirile și compatibilitatea țintelor, fără a fi nevoie de aliniere.
Potrivit benchmark-urilor efectuate pe un computer desktop Mac, kallisto poate cuantifica 30 de milioane de citiri de ARN-seq uman în mai puțin de 3 minute cu doar secvențele de citit și un index de transcriptom, care în sine poate dura mai mult de 10 minute pentru a construi. Și, deoarece utilizează pseudoalinierea, este rezistent la erori în citiri și păstrează informațiile cheie necesare pentru cuantificare. Acest lucru face ca kallisto nu numai să fie rapid, ci și foarte precis. În multe benchmark-uri, chiar depășește cu mult instrumentele existente.
DESCRIERE
- Utilizează pseudoalinierea
- Rapidă și precisă
- ARN-Seq în vrac cuantificat poate fi analizat cu detectiv
- Poate fi folosit cu bustools pentru a preprocesa datele ARN-seq unicelulare
Limbaj de programare
C
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.