Aceasta este aplicația Windows numită MetaPhat -meta-pheno-association-tracker a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca plasma_lipids_decomposed.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MetaPhat -meta-pheno-association-tracker cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
CAPTURĂ DE ECRAN:
MetaPhat -meta-feno-asociere-tracker
DESCRIERE:
MetaPhat este un program cu sursă deschisă pentru a detecta trăsăturile optime ale subsetului de asocieri SNP de plumb din rezultatele rezumate GWAS cu biomarkeri multipli. Cele mai bune trăsături sunt derivate din descompunerea sistematică a asociațiilor multivariate în trăsături centrale bazate pe BIC și valoarea P optimă din modelele CCA multivariate. Rezultatele urmelor SNP sunt reprezentate grafic și grupate pentru a diseca și a îmbunătăți specificitatea asociațiilor fenotip-genotip mv.
eliberat cu funcția LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Pornire rapidă https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
Intrări https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Exemplu de lipide globale https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Citate: Lin și colab. (2020) MetaPhat: Detectarea și descompunerea asociațiilor multivariate din statisticile univariate de asociere la nivelul genomului. Față. Genet. doi: 10.
DESCRIERE
- analiza multivariată a trăsăturilor la nivelul genomului
- Selecția optimă a subsetului de trăsături bazată pe valoarea p și BIC
- diagrame cu urme de descompunere a trăsăturilor
- Populația și aglomerarea blocului LD
- conduce SNP și fișierul rezumat al trăsăturilor conducătorului auto
- snp-snp trăsătură rank spearman cluster
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.