Это команда cmtk-dwi_mask_bad_slices, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
dwi_mask_bad_slices - находит плохие срезы в наборе изображений с взвешенными по диффузии.
СИНТАКСИС
dwi_mask_bad_slices Диффузионные пути изображения
ОПИСАНИЕ
Этот инструмент считывает набор трехмерных МР-изображений, взвешенных по диффузии, и находит плохие срезы. Плохой кусок
в диффузном изображении определяется как изображение, средняя интенсивность которого выходит за пределы указанного
интервал вокруг среднего значения всех соответствующих срезов из оставшихся
диффузные изображения.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
Глобальный Инструментарий Опции (эти Он общие by Найти СМТК инструменты)
--Помогите
Записать список основных параметров командной строки в стандартный вывод.
--help-all
Записать полный список основных и расширенных параметров командной строки в стандартный вывод.
--вики
Записать список параметров командной строки в стандартный вывод в разметке MediaWiki.
--человек
Напишите исходный код страницы руководства в разметке nroff для стандартного вывода.
--версия
Напишите версию инструментария для стандартного вывода.
- эхо
Записать текущую командную строку в стандартный вывод.
--verbose-уровень
Установите уровень детализации.
--подробный, -v
Увеличить уровень детализации на 1 (не рекомендуется; поддерживается для обратной совместимости).
--потоки
Установите максимальное количество параллельных потоков (для потоков POSIX и OpenMP).
вход Опции
--b0count
Количество изображений b = 0 в начале списка изображений. Они не включены в
обнаружение плохих срезов или маскирование, но также записываются в выходной каталог для
удобство. Предполагается, что все изображения b = 0 находятся в начале списка
входные изображения, но не в конце или в середине. [Дефолт: 0]
--слайс-ориентация
Определите ориентацию среза диффузных изображений. Допустимые значения: «осевой»,
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", где по умолчанию "аксиальный",
или воспользуйтесь одним из следующих способов:
- осевой
Осевые срезы [Эта is домен дефолт]
- сагиттальный
Сагиттальные срезы
- корональный
Коронковые срезы
--slice-х
Ось координаты X - направление среза
--slice-у
Ось координаты Y - направление среза
--slice-z
Ось координаты Z - направление среза [Эта is домен дефолт]
Плохой Ломтик обнаружение
--stdev
Пороговое значение для идентификации плохих срезов в единицах стандартных отклонений интенсивности, превышающих
все соответствующие срезы из оставшихся диффузных изображений. [Дефолт: 3]
Результат Опции
--преобразовать в
Скалярный тип данных для выходных изображений. Если ваше значение заполнения отрицательное, но ваш
входные данные без знака, например, убедитесь, что выбрали подписанный тип данных для
выход. По умолчанию тип выходных данных совпадает с типом входных данных. Поддерживается
значения: «char», «byte», «short», «ushort», «int», «uint», «float», «double» или используйте
одно из следующего:
- char
8 бит, со знаком
--байт
8 бит, без знака
--короткая
16 бит, со знаком
--ушорт
16 бит, без знака
--int
32 бита со знаком
--uint
32 бита без знака
--плавать
32 бита с плавающей запятой
--двойной
64 бита с плавающей запятой
--padding-значение , -p
Значение заполнения для замены данных обнаруженных плохих срезов в выходных изображениях. [Дефолт: -1:XNUMX]
--выходной каталог , -o
Путь к файловой системе для записи изображений с замаскированными плохими фрагментами (т. Е. Заполненными
значение заполнения). [Дефолт: НИКТО]
АВТОРЫ
Торстен Рольфинг, при участии Майкла П. Хасака, Грега Джеффериса, Кэлвина Р.
Маурер, Даниэль Б. Русаков и Ярослав Гальченко
Используйте cmtk-dwi_mask_bad_slices в Интернете с помощью сервисов onworks.net