Это пропрограммированная команда, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
propmapped - вычислить долю отображенных чтений / фрагментов
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
подсказано [опции] -i
Обязательные аргументы:
-i
Входной файл, содержащий результаты сопоставления чтения. Оба формата SAM и BAM являются
поддерживается.
Дополнительные аргументы:
-o
Имя выходного файла, включая статистику сопоставления.
-f Если указано, будут учитываться фрагменты (пары чтения), а не отдельные чтения.
Эта опция применима только для парных чтений.
-p Если указано, будут учитываться только правильно спаренные чтения. Этот вариант только
применимо для парных чтений.
Используйте propmapped онлайн с помощью сервисов onworks.net