Это команда psize, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
psize - Получить размеры и другую информацию из файлов PQR
СИНТАКСИС
размер [--cfact =ценностное ] [--fadd =ценностное ] [--space =ценностное ] [--gememfac =ценностное ]
[--gememceil =ценностное ] [--ofrac =ценностное ] [--redfac =ценностное ] {pqrfile}
размер {--Помогите | -h}
ОПИСАНИЕ
размер извлекает информацию из файлов PQR для подготовки моделей белков и химикатов
для электростатических расчетов. Инструмент рассчитывает размеры для крупной и мелкой сеток,
расстояние между сетками, размер коробки и оценка объема памяти, необходимой для выполнения электростатических измерений.
расчет.
На расчет этой информации можно повлиять, задавая ограничения для размер as
параметры.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
размер принимает следующие варианты:
--Помогите, -h
Распечатайте справочное сообщение и выйдите.
--cfact =ценностное
Фактор, на который увеличиваются размеры молекулы, чтобы получить размеры крупной сетки.
--fadd =ценностное
Сумма, добавляемая к размерам молекулы, чтобы получить точные размеры сетки.
--space =ценностное
Желаемое разрешение мелкой сетки.
--gememfac =ценностное
Количество байтов на точку сетки, необходимое для последовательного вычисления MG.
--gememceil =ценностное
Максимально допустимый МБ для последовательного расчета MG. Отрегулируйте это, чтобы заставить скрипт
выполнять более быстрые вычисления (что требует большего параллелизма).
--ofrac =ценностное
Фактор перекрытия сетчатых перегородок.
--redfac =ценностное
Максимальный коэффициент, на который можно уменьшить размер домена во время фокусировки.
Используйте psize в Интернете с помощью сервисов onworks.net