Это команда TransDecoder.LongOrfs, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
Transdecoder.LongOrfs - Прогнозирование белков транскриптома
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
Требования:
-t transcripts.fasta
Дополнительно:
-м минимальная длина белка (по умолчанию: 100)
-ГРАММ генетический код (по умолчанию: универсальный; см. PerlDoc; варианты: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)
-S нить специфична (анализирует только верхнюю нить)
Генетический Коды
Видетьhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. В настоящее время поддерживаются:
универсальный (по умолчанию)
Эуплоты
Тетрахимена
Candida
Ацетабулярия
Митохондриально-канонический
Митохондриальные позвоночные
Митохондрии-членистоногие
Митохондриальные иглокожие
Митохондриальные моллюски
Митохондриально-асцидийные
Митохондриальные нематоды
Митохондриально-платигельминты
Митохондриальные дрожжи
Митохондриально-эваскомицеты
Митохондриально-простейшие
2015-12-28 ТРАНСДЕКОДЕР.LONGORFS(1)
Используйте TransDecoder.LongOrfs онлайн с помощью сервисов onworks.net