Это приложение Linux под названием MAF, последний релиз которого можно загрузить как MAF.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MAF с помощью OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ:
МАФ
ОПИСАНИЕ:
Нуклеотидные последовательности ДНК и РНК являются неотъемлемой частью всех биологических клеток и служат, с одной стороны, всеобъемлющей библиотекой возможностей для клеток, а с другой – впечатляющей регуляторной системой для управления клеточной функцией. Представленная платформа мультивыравнивания (MAF) должна предоставить исследователям простую платформу для выравнивания последовательностей в качестве функционального шаблона, достаточно гибкого для настройки всех этапов, но также достаточно полного для объединения множества различных инструментов и пользовательских комбинаций параметров, если необходим или рекомендован углубленный анализ, например, в ситуациях с низкой скоростью считывания. Платформа позволяет исследователям применять несколько выравнивателей последовательностей и дополнительные инструменты предварительной и постобработки в гибких комбинациях для анализа как незначительных, так и существенных различий между различными алгоритмами выравнивания и обработки последовательностей, применяемыми к одной и той же базе данных.
Ссылайтесь на следующую публикацию: https://doi.org/10.3390/mps8030065
Особенности
- Совместное применение различных инструментов выравнивания на примере скриптов bash
- Гибкие этапы предварительной и последующей обработки, расширяемые и полностью перестраиваемые
- Шаблоны Bash, которые экономят время разработки
Категории
Это приложение, которое также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/. Оно размещено в OnWorks для того, чтобы его можно было запустить онлайн самым простым способом из одной из наших бесплатных операционных систем.