Это приложение для Linux под названием ParamIT, последнюю версию которого можно загрузить как ParamITPack-1.0.tar.bz2. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием ParamIT с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ:
ПарамИТ
ОПИСАНИЕ:
ParamIT - это набор инструментов, помогающий в разработке параметризации молекулярно-механического силового поля малых, похожих на сопротивление молекул, в рамках протокола общего силового поля CHARMM (CGenFF). Разработанный инструментарий помогает исследователям: 1) автоматизировать создание нескольких входных файлов для программ квантовой и молекулярной механики, 2) автоматизировать анализ результатов и 3) заменить использование полных программ ММ на более быстрые специализированные. Разработанные инструменты включают: 1) генератор комплексов молекула-вода с графическим интерфейсом пользователя (GUI), 2) полуавтоматический частотный анализ с использованием символьной матрицы распределения потенциальной энергии и сравнения оптимизированных внутренних координат, 3) GUI для подбора заряда с тремя режимами : руководство, выборка Монте-Карло или грубая сила, и 4) графический интерфейс для подбора двугранных членов. Использование этих инструментов снижает трудозатраты, снижает количество ошибок ручного ввода и сокращает время, необходимое для точной параметризации MM.
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка, Tk
Язык программирования
С, Питон
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/paramit/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.