Это приложение для Linux под названием qure, последний выпуск которого можно загрузить как QuRe_v0.99971.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием qure бесплатно с OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ:
Qure
ОПИСАНИЕ:
QuRe - это программа для реконструкции квазивидов вируса, специально разработанная для анализа данных NGS с длинным считыванием (> 100 п.н.). Программа выполняет выравнивание фрагментов последовательностей относительно эталонного генома, находит оптимальное разделение генома на скользящие окна на основе охвата и разнообразия и пытается восстановить все отдельные последовательности квазивидов вируса - вместе с их распространенностью - с помощью эвристики. алгоритм, который сопоставляет полиномиальные распределения различных вирусных вариантов, перекрывающихся по делению генома. QuRe поставляется со встроенным методом исправления ошибок Пуассона и вероятностной кластеризацией после реконструкции, оба параметризованных по заданной частоте ошибок в гомополимерных и негомополимерных областях.Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/qure/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.