Это приложение для Linux под названием skewer для запуска в Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как benchmark1-arabidopsis.thaliana-scripts.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием skewer, чтобы запускать его в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
вертел для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ:
В этой программе реализован новый алгоритм динамического программирования, посвященный задаче обрезки адаптера, и он специально разработан для обработки последовательностей с парным концом света.Особенности
- Обнаружение и удаление последовательностей адаптеров
- Вставка и удаление разрешены при сопоставлении с образцом
- Нацелено на одиночный конец, парный конец (PE) и длинную пару сопряжения (LMP) читает
- Демультиплексирование серий секвенирования со штрих-кодом
- Поддержка многопоточности
- Обрезка на основе показателей качества phred
- Символы IUPAC для штрих-кодов и адаптеров
- Поддержка сжатого ввода и вывода
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
C + +
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/skewer/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.