นี่คือคำสั่ง bp_multi_hmmsearch.plp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
multi_hmmsearch - ทำ hmmsearch เป็นไฟล์ FASTA หลายไฟล์โดยใช้
ไฟล์ INDEX
เรื่องย่อ
multi_hmmsearch -p hmm_file [-i] -f index_file
DESCRIPTION
ไม่ใช่ในทางเทคนิค Bio::Tools::Run script เนื่องจากไม่ได้ใช้ Bioperl หรือ Bioperl-run ใดๆ
ส่วนประกอบแต่มีประโยชน์
จำเป็น ตัวเลือก:
-p โปรไฟล์ HMM ที่จะใช้สำหรับการค้นหา
-f ไฟล์ INDEX ที่มีรายการไฟล์ FASTA สำหรับหลายไฟล์
ค้นหา.
พิเศษ ตัวเลือก:
-i สร้างไฟล์ดัชนีใหม่ด้วยไฟล์ hmms ที่เป็นผลลัพธ์ นี่คือ
มีประโยชน์ถ้าคุณต้องการส่งรายการนี้เป็นอาร์กิวเมนต์อินพุตลงใน
โปรแกรมอื่น
-h แสดงเอกสารนี้
การตอบรับ
จดหมาย รายการ
ความคิดเห็นของผู้ใช้เป็นส่วนสำคัญของวิวัฒนาการของโมดูลนี้และโมดูล Bioperl อื่นๆ ส่ง
ข้อคิดเห็นและข้อเสนอแนะของคุณ ควรไปที่รายชื่อผู้รับจดหมายของ Bioperl การมีส่วนร่วมของคุณ
เป็นที่ชื่นชมมาก
bioperl-l@bioperl.org - พูดคุยเรื่องทั่วไป
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - เกี่ยวกับรายชื่อผู้รับจดหมาย
การรายงาน Bugs
รายงานจุดบกพร่องไปยังระบบติดตามจุดบกพร่องของ Bioperl เพื่อช่วยเราติดตามจุดบกพร่องและข้อบกพร่องเหล่านั้น
ปณิธาน. สามารถส่งรายงานข้อบกพร่องผ่านทางเว็บ:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
ใช้ bp_multi_hmmsearch.plp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net