นี่คือคำสั่ง bp_run_neighbor.plp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
run_neighbor - เรียกใช้โปรแกรม 'เพื่อนบ้าน' ของ Phylip ผ่าน Bioperl
เรื่องย่อ
run_neighbor [-i inputfile] [-o ชื่อไฟล์ภายนอก]
DESCRIPTION
ระบุไฟล์เมทริกซ์เพื่อเรียกใช้เพื่อนบ้าน ไฟล์ควรเป็นชื่อรูปแบบ file.matrix
หรือ file.protdist (ตอนจบไม่สำคัญ แต่โปรแกรมคาดหวังไฟล์ในรูปแบบ
(\S+)\.(\S+)
สิ่งนี้จะเรียกใช้แอปพลิเคชัน 'เพื่อนบ้าน' เพื่อสร้างต้นไม้ที่เข้าร่วมเพื่อนบ้านจากโปรตีน
เมทริกซ์ระยะทาง
ใช้ bp_run_neighbor.plp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net