นี่คือคำสั่ง bp_seqpartp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
bp_seqpart.pl - นำไฟล์ลำดับตั้งแต่หนึ่งไฟล์ขึ้นไปและแบ่งออกเป็นไฟล์จำนวนมาก
ไฟล์ที่สมดุล
การใช้
bp_seqpart.pl -n [-h, -p , -NS , -o ]
-n จำนวนไฟล์ที่จะสร้างผ่านการแบ่งพาร์ติชั่น
-h ข้อความช่วยเหลือนี้
-p คำนำหน้าสำหรับเอาต์พุตชื่อไฟล์ FASTA ทั้งหมด ไฟล์อยู่ในรูปแบบ / #.
-f ของไฟล์ ค่าเริ่มต้นเป็น FASTA แต่คุณสามารถระบุอะไรก็ได้ที่ SeqIO รองรับจาก BioPerl
-o ไดเร็กทอรีเอาต์พุตที่จะดัมพ์ไฟล์ลำดับแยก
DESCRIPTION
การห่อสคริปต์ SeqIO ที่อนุญาตให้แบ่งพาร์ติชั่นไฟล์หลาย ๆ ลำดับให้ใกล้เคียงกัน
ชิ้นส่วนขนาดสำหรับการประมวลผลแบบขนานในภายหลัง แม้ว่าคุณจะมีไฟล์อินพุต 10 ไฟล์ที่ส่งออกไปยัง
10 ไฟล์จะปรับสมดุลไฟล์ให้มีความยาวรวมของลำดับใกล้เคียงกัน ไอดีคือ
ละเลยเมื่อตัดสินใจว่าจะปรับสมดุลแต่ละลำดับอย่างไร
ใช้ bp_seqpartp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net