นี่คือคำสั่ง fastq_quality_filter ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
fastq_quality_filter - กรองลำดับตามคุณภาพ
DESCRIPTION
การใช้งาน: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] ส่วนหนึ่งของ
FASTX Toolkit 0.0.14 โดย A. Gordon (assafgordon@gmail.com)
[-h] = หน้าจอช่วยเหลือที่เป็นประโยชน์นี้
[-q N] = คะแนนคุณภาพขั้นต่ำที่จะเก็บไว้
[-p N] = เปอร์เซ็นต์ขั้นต่ำของเบสที่ต้องมีคุณภาพ [-q]
[-z] = บีบอัดเอาต์พุตด้วย GZIP
[-i เข้าแฟ้ม]
= ไฟล์อินพุต FASTA/Q ค่าเริ่มต้นคือ STDIN
[-o OUTFILE] = ไฟล์เอาต์พุต FASTA/Q ค่าเริ่มต้นคือ STDOUT [-v] = ละเอียด -
รายงานจำนวนลำดับ
หากระบุ [-o]
รายงานจะถูกพิมพ์ไปที่ STDOUT
หากไม่ได้ระบุ [-o] (และเอาต์พุตไปที่ STDOUT) รายงานจะถูกพิมพ์ไปที่
สแตเดอร์
ใช้ fastq_quality_filter ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net