นี่คือคำสั่ง gbseqget ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
gbseqget - ลำดับรูปแบบจาก GenBank เป็น XML GBSet
เรื่องย่อ
gbseqget [-] [-d ชื่อไฟล์] [-i ชื่อไฟล์] [-m ไม่มี/พี/ข] [-n] [-o ชื่อไฟล์] [-v]
DESCRIPTION
gbseqget ดึงข้อมูลลำดับทางชีวภาพจาก GenBank (ตามรายการอินพุตของ GI
หมายเลขภาคยานุวัติ) และพิมพ์ออกมาเป็นเอกสาร XML GBSet
OPTIONS
สรุปตัวเลือกอยู่ด้านล่าง
- พิมพ์ข้อความการใช้งาน
-d ชื่อไฟล์
ป้อนชื่อไฟล์สำหรับรายการวันที่ (ภาคยานุวัติที่ต้องการ หนึ่งรายการต่อบรรทัด ตามด้วย a
บรรทัดว่างและรายการวันที่อนุญาต หนึ่งบรรทัดต่อหนึ่งบรรทัด)
-i ชื่อไฟล์
ป้อนชื่อไฟล์สำหรับรายการ GI (ค่าเริ่มต้น = stdin)
-m ไม่มี/พี/ข
ประเภทโมเลกุล:
n นิวคลีโอไทด์ (ค่าเริ่มต้น)
พี โปรตีน
b ทั้งสอง
-n ส่งกลับเฉพาะระเบียนใหม่ (ซึ่ง GI ที่กำหนดหมายถึงเวอร์ชันเก่า)
-o ชื่อไฟล์
ชื่อไฟล์เอาต์พุตสำหรับ XML GBSet (ค่าเริ่มต้น = stdout)
-v ดึงข้อมูลรูปแบบ SNP
หมายเหตุ
รูปแบบ GBSet เลิกใช้แล้วสำหรับ INSDSet ซึ่งคุณสามารถสร้างได้โดยการเรียกใช้
insdseqget แทนที่ gbseqget.
ใช้ gbseqget ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net