นี่คือแอป Linux ชื่อ CaptureProbe ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น Runningexample.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า CaptureProbe พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
แคปเจอร์โพรบ
รายละเอียด:
ที่นี่ เราพัฒนา CaptureProbe ซึ่งเป็นเครื่องมือ Java แบบกราฟิกที่ใช้งานง่ายสำหรับการออกแบบโพรบดักจับสำหรับแอปพลิเคชัน Capture Hi-C CaptureProbe ใช้งานง่าย เพียงต้องการไฟล์อินพุตที่เรียบง่าย และมีพารามิเตอร์มากมายสำหรับการออกแบบโพรบ CaptureProbe สามารถออกแบบโพรบเฉพาะสำหรับไซต์จีโนมและบริเวณจีโนมที่สนใจโดยเฉพาะ การเปรียบเทียบกับซอฟต์แวร์ที่มีอยู่ (HiCapTools และ GOPHER) ระบุว่า CaptureProbe มีอัตราส่วนความสำเร็จในการออกแบบที่ดีและมีความจำเพาะของโพรบที่ดีกว่า
อ้างอิง: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020 CaptureProbe: เครื่องมือจาวาสำหรับการออกแบบโพรบสำหรับแอปพลิเคชันการจับภาพ Hi-C Zool Res [J], 41: 94-96.
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/captureprobe/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา