นี่คือแอป Linux ชื่อ GENIE (GEne-geNe IntEraction) ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ GENIE_src.tar สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ GENIE (GEne-geNe IntEraction) พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
GENIE (การโต้ตอบของยีน-geNe)
รายละเอียด:
ปฏิสัมพันธ์ระหว่างยีนกับยีนในการศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมนั้นต้องใช้การคำนวณอย่างเข้มข้นเมื่อมี SNP จำนวนมากที่เกี่ยวข้อง หน่วยประมวลผลกลาง (CPU) ล่าสุดส่วนใหญ่มีหลายคอร์ ในขณะที่หน่วยประมวลผลกราฟิก (GPU) ยังมีคอร์หลายร้อยคอร์ และเพิ่งถูกนำมาใช้เพื่อปรับใช้ซอฟต์แวร์ทางวิทยาศาสตร์ที่เร็วขึ้น อย่างไรก็ตาม ขณะนี้ยังไม่มีชุดซอฟต์แวร์การวิเคราะห์ทางพันธุกรรมที่อนุญาตให้ผู้ใช้ใช้พลังการประมวลผลของอุปกรณ์มัลติคอร์เหล่านี้อย่างเต็มที่สำหรับการวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ทางพันธุกรรมสำหรับลักษณะไบนารี
ที่นี่เราขอนำเสนอชุดซอฟต์แวร์ใหม่ GENIE ซึ่งใช้พลังของแกนประมวลผล GPU หรือ CPU หลายตัวเพื่อวิเคราะห์การโต้ตอบแบบขนาน
การอ้างอิง: Chikkagoudar, S. , Wang, K. , & Li, M. (2011) GENIE: ชุดซอฟต์แวร์สำหรับการวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ระหว่างยีนกับยีนในการศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมโดยใช้แกนประมวลผล GPU หรือ CPU หลายตัว บันทึกการวิจัย BMC, 4(1), 158.
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
C
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/gpugenie/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา