นี่คือแอป Linux ชื่อ PTESFinder ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น ptesfinder_v1.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ PTESFinder พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
PTESFinder
รายละเอียด:
PTESFinder เป็นไปป์ไลน์การคำนวณสำหรับระบุเหตุการณ์การสับเปลี่ยน Exon ภายหลังการถอดเสียงจากข้อมูล RNAseq ปริมาณงานสูง PTESFinder ใช้ประโยชน์จากพลังของเครื่องมือ RNASeq ที่จัดตั้งขึ้น และแยกคลาสที่รู้จักทั้งหมดของโครงสร้างผลบวกเท็จอย่างเป็นระบบ โดยใช้ตัวกรองที่เข้มงวดซึ่งออกแบบมาเพื่อกำหนดเป้าหมายผลบวกลวงเหล่านี้โดยเฉพาะ PTESFinder เปรียบเทียบคุณภาพการจัดตำแหน่งของการแมปการอ่านกับโครงสร้าง PTES สมมุติที่มีคุณสมบัติของการอ่านแบบเดียวกันเมื่อจับคู่กับบริเวณจีโนมและการถอดเสียงแบบประกบตามบัญญัติ แนวทางนี้ช่วยเพิ่มความมั่นใจในการสนับสนุนการอ่าน PTES การอ่านที่เกิดจากเหตุการณ์การเปลี่ยนเทมเพลตมักจะมีลักษณะเฉพาะด้วยอินเดลขนาดใหญ่เมื่อจัดแนวกับทรานสคริปต์ PTESFinder ใช้ตัวกรองเพิ่มเติมเพื่อแยกการอ่านที่มีการจัดตำแหน่งคลุมเครือรอบทางแยก PTES exon-exon ช่วยเพิ่มความมั่นใจในการอ่านที่รองรับเหล่านี้ PTESFinder ระบุโครงสร้าง PTES มากกว่าวิธีการเผยแพร่อื่น ๆ ในขณะที่ยังคงความจำเพาะสูง
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
ยูนิกซ์ เชลล์, จาวา
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา