นี่คือแอป Linux ชื่อ QUASR ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น QUASR_v6.08.tar สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ QUASR พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ:
ควาเอสอาร์
รายละเอียด:
QUASR เป็นไปป์ไลน์น้ำหนักเบาที่เขียนขึ้นเพื่อประมวลผลและวิเคราะห์ข้อมูลการจัดลำดับยุคหน้า (NGS) จากแพลตฟอร์ม Illumina, 454 และ Ion Torrent แม้ว่าเดิมจะเขียนขึ้นสำหรับข้อมูลไวรัส แต่ก็เป็นข้อมูลทั่วไปที่เพียงพอสำหรับใช้กับชุดข้อมูล NGS ใดๆ ฟังก์ชั่นรวมถึง:
ลบซ้ำ
การทำ demultiplexing
ไพรเมอร์-กำจัด
การประกันคุณภาพ (QA) กราฟ
การควบคุมคุณภาพ (QC)
ฉันทามติ-รุ่น
การกำหนดตัวแปรส่วนน้อย
กราฟส่วนน้อย-ตัวแปร
เวอร์ชันหลักในปัจจุบันคือ 6.X ซึ่งเขียนด้วย Python3 7.X คือการเขียนซ้ำของฉันใน Java แต่ยังคงดำเนินการอยู่ ทั้งสองอย่างนี้เขียนให้มีน้ำหนักเบาที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ เพื่อให้สามารถทำงานโดยมีความต้องการหน่วยความจำน้อยที่สุดบนเดสก์ท็อปหรือแล็ปท็อปตลอดจนบนคลัสเตอร์คอมพิวเตอร์
หากคุณมีปัญหาใด ๆ กับ QUASR โปรดติดต่อฉันตามที่อยู่อีเมลที่ให้ไว้ใน README
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
หลาม
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/quasr/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา