นี่คือแอป Windows ชื่อ Alphafold ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ Alphafoldv2.3.2.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ได้ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ Alphafold พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ:
อัลฟ่าโฟลด์
รายละเอียด:
แพ็คเกจนี้จัดเตรียมการใช้งานไพพ์ไลน์การอนุมานของ AlphaFold v2.0 นี่เป็นโมเดลใหม่ทั้งหมดที่ถูกป้อนใน CASP14 และเผยแพร่ใน Nature เพื่อความง่าย เราเรียกโมเดลนี้ว่า AlphaFold ตลอดทั้งส่วนที่เหลือของเอกสารนี้ สิ่งพิมพ์ใดๆ ที่เปิดเผยผลการวิจัยที่เกิดจากการใช้ซอร์สโค้ดนี้หรือพารามิเตอร์แบบจำลอง ควรอ้างอิงเอกสาร AlphaFold โปรดดูข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับคำอธิบายโดยละเอียดของวิธีการ คุณสามารถใช้ AlphaFold เวอร์ชันที่เรียบง่ายกว่าเล็กน้อยกับโน้ตบุ๊ก Colab หรือเวอร์ชันที่ชุมชนสนับสนุน ขนาดการดาวน์โหลดรวมสำหรับฐานข้อมูลแบบเต็มจะอยู่ที่ประมาณ 415 GB และขนาดทั้งหมดเมื่อคลายซิปคือ 2.2 TB โปรดตรวจสอบให้แน่ใจว่าคุณมีพื้นที่ว่างบนฮาร์ดไดรฟ์ แบนด์วิดท์ และเวลาเพียงพอในการดาวน์โหลด เราแนะนำให้ใช้ SSD เพื่อประสิทธิภาพการค้นหาทางพันธุกรรมที่ดีขึ้น
คุณสมบัติ
- AlphaFold ต้องการฐานข้อมูลทางพันธุกรรม (ลำดับ) หลายฐานข้อมูลเพื่อเรียกใช้
- แม้ว่ารหัส AlphaFold จะได้รับอนุญาตภายใต้สัญญาอนุญาต Apache 2.0 พารามิเตอร์ AlphaFold จะพร้อมใช้งานสำหรับการใช้งานที่ไม่ใช่เชิงพาณิชย์
- โมเดล 5 แบบที่ใช้ระหว่าง CASP14 และได้รับการตรวจสอบอย่างครอบคลุมสำหรับคุณภาพการทำนายโครงสร้าง
- โมเดล 5 pTM ซึ่งปรับแต่งมาอย่างดีเพื่อผลิต pTM
- วิธีที่ง่ายที่สุดในการรัน AlphaFold คือการใช้สคริปต์ Docker ที่ให้มา
- โดยค่าเริ่มต้น Alphafold จะพยายามใช้อุปกรณ์ GPU ที่มองเห็นได้ทั้งหมด
ภาษาโปรแกรม
หลาม
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา