นี่คือแอป Windows ชื่อ kallisto ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น kallisto_windows-v0.50.0.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ kallisto พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ:
คัลลิสโต
รายละเอียด:
kallisto เป็นโปรแกรมสำหรับการหาปริมาณการถอดรหัสจากข้อมูล RNA-Seq ที่ใกล้เคียงที่สุด หรือโดยทั่วไปแล้วของลำดับเป้าหมายโดยใช้การอ่านลำดับที่มีปริมาณงานสูง โดยอิงจากแนวคิดในการใช้การจัดตำแหน่งเทียมเพื่อระบุความเข้ากันได้ของการอ่านและเป้าหมายอย่างรวดเร็ว โดยไม่ต้องมีการจัดตำแหน่ง
ตามเกณฑ์มาตรฐานที่ทำบนคอมพิวเตอร์เดสก์ท็อป Mac kallisto สามารถหาปริมาณ RNA-seq จำนวน 30 ล้านอ่านในเวลาน้อยกว่า 3 นาทีด้วยลำดับการอ่านและดัชนีการถอดรหัส ซึ่งในตัวมันเองอาจใช้เวลามากกว่า 10 นาทีในการสร้าง และเนื่องจากใช้การจัดตำแหน่งเทียม จึงมีประสิทธิภาพต่อข้อผิดพลาดในการอ่านและเก็บรักษาข้อมูลสำคัญที่จำเป็นสำหรับการหาปริมาณ สิ่งนี้ทำให้ kallisto ไม่เพียงแต่เร็วแต่มีความแม่นยำสูงอีกด้วย ในการวัดประสิทธิภาพหลายๆ อย่าง มันมีประสิทธิภาพเหนือกว่าเครื่องมือที่มีอยู่อย่างมากด้วยซ้ำ
คุณสมบัติ
- ใช้การจัดตำแหน่งเทียม
- รวดเร็วและแม่นยำ
- สามารถวิเคราะห์ RNA-Seq จำนวนมากในเชิงปริมาณได้ด้วย sleuth
- สามารถใช้กับ bustools เพื่อประมวลผลข้อมูล RNA-seq เซลล์เดียวล่วงหน้าได้
ภาษาโปรแกรม
C
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา