นี่คือแอป Windows ชื่อ MetaPhat -meta-pheno-association-tracker ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ plasma_lipids_decomposed.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ได้ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ MetaPhat -meta-pheno-association-tracker กับ OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ:
MetaPhat -meta-pheno-สมาคมติดตาม
รายละเอียด:
MetaPhat เป็นโปรแกรมโอเพ่นซอร์สเพื่อตรวจหาลักษณะย่อยที่เหมาะสมที่สุดในการเชื่อมโยง SNP ของลีดจากผลลัพธ์สรุป GWAS ของ biomarker หลายตัว ลักษณะที่ดีที่สุดได้มาจากการแยกย่อยการเชื่อมโยงหลายตัวแปรอย่างเป็นระบบให้เป็นลักษณะกลางตามค่า BIC และ P-value ที่เหมาะสมจากแบบจำลอง CCA หลายตัวแปร ผลลัพธ์การติดตาม SNP ถูกลงจุดและจัดกลุ่มเพื่อแยกและปรับปรุงความจำเพาะของความสัมพันธ์ mv ฟีโนไทป์-จีโนไทป์
ปล่อยด้วยฟังก์ชัน LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
เริ่มต้นอย่างรวดเร็ว https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
ปัจจัยการผลิต https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
ตัวอย่าง Global Lipids https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
อ้างอิง: Lin et al. (2020) MetaPhat: การตรวจจับและแยกย่อยการเชื่อมโยงหลายตัวแปรจากสถิติการเชื่อมโยงทั่วทั้งจีโนมที่ไม่มีตัวแปร ด้านหน้า. เจเนท. ดอย: 10.
คุณสมบัติ
- การวิเคราะห์ลักษณะหลายตัวแปรทั่วทั้งจีโนม
- p-value และการเลือกเซ็ตย่อยของคุณสมบัติที่เหมาะสมที่สุดตาม BIC
- แปลงร่องรอยการสลายตัวของลักษณะ
- การเกาะกลุ่มของประชากรและ LD
- นำ SNP และไฟล์สรุปคุณสมบัติของไดรเวอร์
- snp-snp trait ยศ สเปียร์แมนคลัสเตอร์
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา