นี่คือแอป Windows ชื่อ NGSEP ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น NGSEPwindows_4.1.0.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ NGSEP พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ:
NGSEEP
รายละเอียด:
NGSEP เป็นเฟรมเวิร์กแบบบูรณาการสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลการจัดลำดับปริมาณงานสูงของ DNA การใช้งานหลักของ NGSEP คือการสร้างและการวิเคราะห์ปลายน้ำของชุดข้อมูลขนาดใหญ่ของการแปรผันของจีโนม NGSEP ทำการตรวจจับและการสร้างจีโนไทป์ที่แม่นยำของตัวแปรนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (SNV) อินเดลขนาดเล็กและขนาดใหญ่ การทำซ้ำแบบคู่ขนานสั้น (STR) การผกผัน และตัวแปรจำนวนสำเนา (CNV) NGSEP ยังมีโมดูลสำหรับคำอธิบายประกอบการทำงาน การกรอง การแปลงรูปแบบ การเปรียบเทียบ การจัดกลุ่ม การใส่ข้อมูล การวิเคราะห์เชิงลึกและสถิติประเภทต่างๆ รายการฟังก์ชันทั้งหมดมีอยู่ในวิกิของเรา (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
ข่าว: เราเพิ่งเปิดตัวแอสเซมเบลอร์จีโนม de-novo เวอร์ชันแรกของเรา รายละเอียดเพิ่มเติมมีอยู่ในวิกิ
คุณสมบัติ
- การประกอบจีโนม De-novo
- การจัดตำแหน่งของการอ่านข้อมูลดิบกับจีโนมอ้างอิง
- SNPs, CNV และการตรวจจับแวเรียนต์โครงสร้าง
- การจัดการ VCF: คำอธิบายประกอบการทำงาน การผสาน กรอง เปรียบเทียบ การแปลงรูปแบบ การใส่แทนค่า
- อ่าน Demultiplexing
- การจัดตำแหน่งของชุดจีโนมที่มีคำอธิบายประกอบ
- สถิติและการกรองคำอธิบายประกอบการถอดเสียงในรูปแบบ GFF3
ผู้ชม
อุตสาหกรรมการดูแลสุขภาพ, วิทยาศาสตร์/การวิจัย, ผู้ชมอื่นๆ, เกษตรกรรม
ส่วนติดต่อผู้ใช้
Java SWT, คอนโซล/เทอร์มินัล, Eclipse
ภาษาโปรแกรม
ชวา
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/ngsep/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา