cmtk-asegment_sri24 - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

asegment_sri24 - Segmentation gamit ang SRI24 atlas

SINOPSIS

asegment_sri24 TargetImage OutputImage

DESCRIPTION

Magrehistro ng isang target na imahe sa isang napiling channel ng SRI24 atlas ng utak ng tao, kung gayon
i-reformat ang isa sa mga mapa ng atlas label sa target na imahe. Tandaan: ipinapalagay na ang
ang target na imahe ay skull-stripped, ibig sabihin, naglalaman lamang ng utak.

Opsyon

Global Toolkit Options (ito ay Nagbahagi by lahat CMTK kasangkapan)
- Tumulong
Sumulat ng listahan ng mga pangunahing opsyon sa command line sa karaniwang output.

--tulong-lahat
Sumulat ng kumpletong listahan ng basic at advanced na mga opsyon sa command line sa karaniwang output.

--wiki
Isulat ang listahan ng mga opsyon sa command line sa karaniwang output sa MediaWiki markup.

--lalaki
Isulat ang man page source sa 'nroff' markup sa karaniwang output.

--xml
Sumulat ng detalye ng command line syntax sa XML markup (para sa pagsasama ng Slicer).

--bersyon
Isulat ang bersyon ng toolkit sa karaniwang output.

--echo
Isulat ang kasalukuyang command line sa karaniwang output.

--verbose-level
Itakda ang antas ng verbosity.

--verbose, -v
Dagdagan ang antas ng verbosity ng 1 (hindi na ginagamit; suportado para sa backward compatibility).

--mga thread
Itakda ang maximum na bilang ng mga parallel na thread (para sa POSIX thread at OpenMP).

Pangunahin Options
--mabilis, -f
Mabilisan.

--registration-channel
Ang SRI24 channel na ginamit para sa pagpaparehistro sa target na imahe. Mga sinusuportahang halaga:
"spgr", "early-fse", "late-fse", "fa", kung saan ang default ay "spgr", o gumamit ng isa sa
sumusunod:

--spgr
SPGR (T1-weighted) structural channel [Ito is ang default]

--maagang-fse
Maagang-echo (PD-weighted) mabilis na spin echo channel

--huli-fse
Late-echo (T2-weighted) fast spin echo channel

--fa Fractional anisotropy channel, na nagmula sa diffusion tensor na mga imahe

--label-mapa
Ang SRI24 label na mapa na na-reformat sa target na imahe. Mga sinusuportahang halaga:
"tzo116plus", "lpba40", "tissue", kung saan ang default ay "tzo116plus", o gumamit ng isa sa
ang mga sumusunod:

--tzo116plus
Extended cortical parcellation template batay sa Tzourio-Mazoyer AAL 116 na rehiyon
template. [Ito is ang default]

--lpba40
Template batay sa 40 paksa LONI Probabilistic Brain Atlas segmentation.

--tissue
SRI24 maximum na posibilidad na tatlong compartment (GM, WM, CSF) tissue segmentation
mapa.

MGA AUTHORS

Torsten Rohlfing, na may mga kontribusyon mula kay Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, at Yaroslav Halchenko

Gamitin ang cmtk-asegment_sri24 online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net