cmtk-reformatx - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

reformatx - Volume reformatter

SINOPSIS

reformatx [mga opsyon] --floating floatingImg target x0 [x1 ...]
O reformatx [mga opsyon] target [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
O SAAN ang x0 ... xN at xx0 ... xxN ay [{-i,--inverse}] transformation##. (Kung ang una
ang pagbabagong-anyo sa pagkakasunud-sunod ay baligtad, pagkatapos ang '--inverse' ay dapat unahan ng '--',
ibig sabihin, gamitin ang '-- --inverse xform.path').

DESCRIPTION

Extended volume reformatter tool para kalkulahin ang na-reformat na mga imahe at Jacobian na mga mapa mula sa
arbitrary na pagkakasunud-sunod ng pinagsama-samang pagbabago

Opsyon

Global Toolkit Options (ito ay Nagbahagi by lahat CMTK kasangkapan)
- Tumulong
Sumulat ng listahan ng mga pangunahing opsyon sa command line sa karaniwang output.

--tulong-lahat
Sumulat ng kumpletong listahan ng basic at advanced na mga opsyon sa command line sa karaniwang output.

--wiki
Isulat ang listahan ng mga opsyon sa command line sa karaniwang output sa MediaWiki markup.

--lalaki
Isulat ang man page source sa 'nroff' markup sa karaniwang output.

--bersyon
Isulat ang bersyon ng toolkit sa karaniwang output.

--echo
Isulat ang kasalukuyang command line sa karaniwang output.

--verbose-level
Itakda ang antas ng verbosity.

--verbose, -v
Dagdagan ang antas ng verbosity ng 1 (hindi na ginagamit; suportado para sa backward compatibility).

--mga thread
Itakda ang maximum na bilang ng mga parallel na thread (para sa POSIX thread at OpenMP).

--outputtype
Uri ng data ng scaler para sa output na imahe. Mga sinusuportahang halaga: "char", "byte", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double", o gumamit ng isa sa mga sumusunod:

--char
8 bits, nilagdaan

--byte
8 bits, hindi nalagdaan

--maikli
16 bits, nilagdaan

--ushort
16 bits, hindi nalagdaan

--int
32 bits na nilagdaan

--uint
32 bits unsigned

--lumutang
32 bits na lumulutang na punto

--doble
64 bits na lumulutang na punto

--pad-out , -P
Halaga ng padding para sa output na imahe [Default: 0]

Options para payak Reformatting
--interpolation
Paraan ng interpolation ng imahe. Mga sinusuportahang halaga: "linear", "nn", "cubic", "pv", "sinc-
cosine", "sinc-hamming", kung saan ang default ay "linear", o gumamit ng isa sa mga sumusunod:

--linear
Trilinear interpolation [Ito is ang default]

--nn Pinakamalapit na interpolation ng kapitbahay

--kubiko
Tricubic interpolation

--pv Interpolation ng partial volume

--sinc-cosine
Sinc interpolation na may cosine window

--sinc-hamming
Sinc interpolation sa Hamming window

--sinc-window-radius
Window radius para sa Sinc interpolation [Default: 3]

--preserba-masa
Mass-preserving reformatting: i-multiply ang bawat na-reformat na value sa Jacobian
determinant ng inilapat na pagbabago.

Options para Jacobian mapa Reformatting
--jacobian-correct-global
Iwasto ang mga mapa ng Jacobian para sa pandaigdigang sukat.

--no-jacobian-correct-global
Huwag itama ang mga mapa ng Jacobian para sa pandaigdigang sukat. [Ito is ang default]

input Options
--target-grid
Tukuyin ang target na grid para sa reformating bilang Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(dims:pixel:offset)

--maskara, -m
Gamitin ang target na pixel data bilang binary mask.

--crop
I-crop ang target na larawan: x0,y0,z0,x1,y1,z2

--target-offset , -O
I-override ang offset ng target na imahe at itakda sa x,y,z mm

--target-offset-pixels
I-override ang target na image offset at itakda sa dx,dy,dz pixels

--lumulutang , -F
Format at landas ng lumulutang na imahe. [Default: WALA]

--pad-lumulutang
Padding value para sa lumulutang na imahe [Default: may kapansanan]

Pagbubuhos Options
--outfile , -o
Format at landas ng output na imahe. [Default: reformat.nii ]

Larawan/Pagbabago Database
--db
Path sa database ng imahe/pagbabagong-anyo na dapat i-update sa bagong likha
larawan. [Default: WALA]

MGA AUTHORS

Torsten Rohlfing, na may mga kontribusyon mula kay Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, at Yaroslav Halchenko

Gumamit ng cmtk-reformatx online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net