Ito ang command na go-show-paths-to-rootp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
go-show-paths-to-root.pl - ipinapakita ang lahat ng posibleng landas mula sa isang termino hanggang sa tuktok
SINOPSIS
go-show-paths-to-root.pl -id GO:0008021 ontology/gene_ontology.obo
go-show-paths-to-root.pl -names -id GO:0008021 ontology/gene_ontology.obo
DESCRIPTION
binabagtas ang DAG na nagpapakita ng lahat ng mga landas (mga termino at intervening na relasyon) patungo sa ugat
Ang script na ito ay puro file based; kailangan nitong i-parse ang ontology sa bawat oras
Ang mga kasunod na pag-parse ay maaaring mapabilis gamit ang opsyon na use_cache
Kung nais mong gamitin ang GO MySQL db, tingnan ang script na go-db-show-paths-to-root.pl sa go-
pamamahagi ng db-perl
MGA PANGANGATWIRANG
-e ERRFILE
nagsusulat ng mga error sa pag-parse sa XML - mga default sa STDERR (dapat walang mga error sa pag-parse nang maayos
nabuong mga file)
-p FORMAT
tinutukoy kung aling parser ang gagamitin; kung hindi tinukoy, gagawa ng hula batay sa file
panlapi. Tingnan sa ibaba para sa mga format
-use_cache
Kung tinukoy ang switch na ito, naka-on ang caching mode.
Sa caching mode, sa unang pagkakataong mag-parse ka ng file, magkakaroon ng karagdagang file
na-export sa isang espesyal na format na mabilis i-parse. Ang file na ito ay magkakaroon ng parehong filename
bilang orihinal na file, maliban kung magkakaroon ito ng ".cache" na suffix.
Sa susunod na i-parse mo ang file, awtomatikong susuriin ng program na ito ang pagkakaroon
ng ".cache" na file. Kung mayroon ito, at mas bago kaysa sa file na iyong tinukoy, ito
ay na-parse sa halip. Kung hindi ito umiiral, ito ay itinayong muli.
Dokumentasyon
<http://www.godatabase.org/dev>
Gumamit ng go-show-paths-to-rootp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net